学院与苏州市规划局、苏州市环保局、姑苏区环保局、高新区环保局、苏州市环境科学学会、苏州市环境保护产业协会、高新区环保产业园、高新区环保产业协会、苏州市外国语学校等建立了长期合作关系；与中国科学院南京地理与湖泊研究所、厦门城市环境所、江南大学、江苏大学等高校和研究院所建立科研合作关系；与江苏苏净集团有限公司、高新区污水处理有限公司、苏州市排水公司、苏州市环境工程公司、苏州东方环境工程公司等建立了校企合作关系，并设立了7个江苏省企业研究生工作站。